Module: Biochemie 1

Cursusdoelen (leerdoelen)

• Duidt de betekenis van de aminozuur-samenstelling cq volgorde voor de structuur van een eiwit
• Herkent de structuur-elementen in eiwitten
• Kan met PyMol eiwitstructuren bekijken en manipuleren
• Weet hoe de validatie van eiwitstructuren gedaan wordt
• Begrijpt de thermodynamica van chemische reacties en de invloed van enzymen op deze reacties in het bijzonder
• Voorspelt het ladingsgedrag van eiwitten
• Karakteriseert het katalytisch gedrag van eiwitten cq enzymen
• Verklaart de werking van bepaalde stoffen op de kinetiek van een enzym
• Geeft aan wat de rol en positie van lipiden en eiwitten in een biologisch membraan is
• Duidt de betekenis van bovengenoemde bouwstenen voor het functioneren van een organisme tot op zekere hoogte

Inhoud

In Biochemie 1 staat het eiwitmolecuul centraal. Structuur, dynamica en functie. Structuur en dynamica van eiwitten kun je visualiseren met onder andere PyMol, een Python based programma. Enzymen zijn eiwitten met een speciale functie: het uitvoeren van chemische reacties. De reactiemechanismen en de kinetiek van enzymen kunnen goed gemodelleerd worden. In Biochemie 1 voor BIN gaan we dan ook in op de bioinformatica van eiwitten om zo de stof eigen te maken.

Beoordeling Tussentijdse toets kennis aminozuren: 10% Schriftelijk tentamen in tentamenweek: 90%

Literatuur en andere bronnen

Literatuur

• Biochemistry: A Short Course, 4rd Edition. J.L. Tymoczko, J.M. Berg, L. Stryer. ISBN: 9781319153878. Behandelde Hoofdstukken: 1 t/m 4, 6 t/m 9, 11 en 12

Web

• Blackboard course thema 5

Competenties

-

Werkvormen

• Hoor/werkcollege

Ingangseisen

-

Ingangseisen toets

-

Voorkennis

-

Voorkennis kan worden opgedaan met

-

Bronnen van zelfstudie

-

Verplicht materiaal

-

Aanbevolen materiaal

-